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sábado, 28 de noviembre de 2015

Notebooks jupyter en pdf via pandoc

Para poder controlar todos los detalles de la impresión de los notebooks de jupyter, podemos volcarlos primero a formato markdown y de ahí convertirlos a tex o pdf via pandoc. En general, el paso a pdf funciona muy bien con la plantilla article pero siempre hay detalles que podemos modificar en el tex que se genera de intermedio.

Si queremos que pandoc nos genere el pdf directamente, hacemos

``` convert.sh
jupyter nbconvert --to markdown $1.ipynb
pandoc $1.md -s -o $1.pdf
```

Si queremos volcar antes a tex para editarlo

``` convert_tex.sh
jupyter nbconvert --to markdown $1.ipynb
pandoc $1.md -f markdown -t latex -s -o $1.tex
```

En realidad esto debería generar el mismo tex que exportar directamente desde jupyter.

Personalizar manualmente el documento latex que genera pandoc

Podemos personalizar el documento tex es añadiendo algunos comandos adicionales.

Idioma

En la cabecera del documento

\usepackage[catalan]{babel}


Título del documento

Justo antes del begin document

\title{Títol del document \\ Autor: Pere Vilás}


y justo después

\begin{document}


\maketitle
    
\tableofcontents    

La razón de tener que poner el título a mano es que sale como sección y queda mal en el índice.

Imágenes

Las imágenes salen del markdown sin tamaño, así que hay que ir una por una añadiendo el width o la scale. También se puede aprovecha para cambiar el caption:

\begin{figure}[htbp]
\centering
\includegraphics[width=75mm]{X1.jpg}
\caption{X1}
\end{figure}


Saltos de página

Algunas veces las imágenes u otros elementos no quedan bien colocados, generalmente sólo hay que introducir algún final de página para que queden en su sitio.

\newpage

Usar metadatos de pandoc

Este método de personalización es más automático que el anterior y no hay que editar el tex. Consiste en editar el markdown para añadir la cabecera al principio del documento. Las cabeceras de metadatos de makdown están en formato yaml y lucen tal que así (hay que poner las tres rayas de inicio y final):


``` cabecera del documento markdown
---
title: Título del documento
author: Pepe Pérez
header-includes:
    - \usepackage[utf8]{inputenc}
    - \usepackage[catalan]{babel}
    - \usepackage{fancyhdr}
    - \pagestyle{fancy}
    - \rhead{Universidad a distáncia}
    - \lhead{Asignatura xxxx}
    - \rfoot{\thepage}
    - \fancyfoot[CO,CE]{Prueba3}
toc:
    true
---
```

Estos metadatos instruyen a pandoc para formatear el documento de salida. De esta forma podemos generar el pdf personalizado directamente a partir del md con

pandoc doc.md -o doc.pdf

Personalización máxima de la salida de pandoc

También podemos modificar directamente la plantilla de pandoc personalizándola según nuestros intereses. Primero hacemos una copia de la plantilla por defecto con

pandoc -D latex > plantilla.tex

Personalizamos la plantilla y generamos el pdf 

pandoc -s -N --template=plantilla.tex doc.md -o doc.pdf






martes, 17 de noviembre de 2015

Python simbólico resolver ecuación

Resolver esta ecuación en wolfram alpha,




... y su equivalente usando sympy



>>> from sympy import symbols, var
>>> v1,v2,v3,vo,r1,r2,r3,r4,rf=symbols('v1,v2,v3,vo,r1,r2,r3,r4,rf')
>>> from sympy.solvers import solve
>>> from sympy import init_printing
>>> init_printing(use_unicode=False, wrap_line=False, no_global=True)
>>> solve(v1/r1 + v2/r2 - ((v3*(r4/(r3+r4)))-vo)/rf, vo)
 r1*r2*r4*v3 - r1*r3*rf*v2 - r1*r4*rf*v2 - r2*r3*rf*v1 - r2*r4*rf*v1 
[-------------------------------------------------------------------]
                           r1*r2*(r3 + r4)                 

jueves, 8 de octubre de 2015

Github da soporte al formato jupyter notebook

Desde Mayo de 2015 github da soporte directo a los notebooks de jupyter. Esto significa que serán renderizados en github antes de visualizarse. Hasta ahora, la única forma de ver los notebooks de otros era usando el servicio gratuito o tenerlos hosteados en alguna plataforma.

Desde ahora, ya tenemos a nuestra disposición todo el poder de github y su control de versiones más el añadido de poder visualizar los cuadernos directamente... Sin duda una combinación que cambiará muchas cosas en la publicación de documentos.

Ejemplo.